Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms