Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4E9QAP7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms