Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930451I11RikE9Q9R3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930451I11RikE9Q9R3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms