Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5407E9Q7Q1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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