Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC030500E9Q6W0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms