Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms