Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf11E9Q6E5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms