Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms