Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17728E9Q5K2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17728E9Q5K2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms