Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nolc1E9Q5C9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nolc1E9Q5C9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms