Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms