Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NbasE9Q411 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NbasE9Q411 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NbasE9Q411 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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NbasE9Q411 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NbasE9Q411 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms