Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms