Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms