Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap46E9Q2C0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap46E9Q2C0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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