Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ccdc171E9Q1U1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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