Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms