Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms