Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms