Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Ryr1E9PZQ0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms