Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf11E9PZM7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms