Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms