Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms