Protein–RNA interactions for Protein: E9PV82

Fam53a, Protein FAM53A, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53aE9PV82 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam53aE9PV82 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam53aE9PV82 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam53aE9PV82 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam53aE9PV82 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam53aE9PV82 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam53aE9PV82 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam53aE9PV82 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam53aE9PV82 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam53aE9PV82 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam53aE9PV82 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms