Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms