Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.33■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.33■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU019823E9PUQ3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AU019823E9PUQ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms