Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde2E9PUP1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms