Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms