Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Piezo1E2JF22 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Piezo1E2JF22 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms