Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930455H04RikD3Z622 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930455H04RikD3Z622 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms