Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2X2

Dnhd1, Dynein heavy chain domain 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnhd1D3Z2X2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dnhd1D3Z2X2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms