Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa28D3Z1V9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms