Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms