Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms