Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42791D3YYB5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms