Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms