Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms