Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc13D3YV10 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms