Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms