Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfap1bC0HKD9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfap1bC0HKD9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms