Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms