Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms