Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm20547B8JJN0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm20547B8JJN0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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