Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Abcc8B2RUS7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms