Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms