Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf3B2RQG2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms