Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1B2KF50 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms