Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H60cB1B213 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H60cB1B213 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H60cB1B213 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms