Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2012B1B0R1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms