Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms